李自成攻北京这段儿时间，大明王朝内部还有着很多势力。
一是武将集团。
明朝末年，面临着内忧外患的严峻局面，内有农民大起义，外有满清的军事威胁，军事上的成败直接关系着大明王朝的生死存亡，在这种情况下，武将的重要性空前突出，激烈的军事斗争为武将势力的崛起提供了舞台。
左良玉是明末著名的武将之一，早年在抗清斗争中崭露头角，受到破格提拔，不久奉命围剿农民军，积极作战，屡次取得胜利，形成了一支著名的左家军。明末文臣多庸碌无为，对武将多方掣肘，文武矛盾日益突出。在激烈的军事斗争中，左良玉因不愿受文臣节制，与文臣之间的矛盾日益尖锐，因而对朝廷的不满倾向日增，开始积极扩充自己的军队，消极作战，不听指挥，不仅摆脱了文臣的控制，甚至使朝廷也无可奈何，最终形成了专制一方，不听节制的军事集团。
而其它武将也纷纷效仿，朝廷逐渐失去了对武将的绝对控制权，使明军在战场上一再溃败，直接加速了明朝灭亡的步伐。
左良玉也早已经成为勇于虐民、怯于大战的大军阀，军队杀掳淫掠可谓无恶不作，比之农民军的部队还不如。
类似这样的明朝武将势力很多很多，说是官，其实比匪徒还不如，甚至更加的残暴。
武将集团中必需提到一人，就是郑芝龙，明末清初最大的海商兼军事集团首领，先后归附明清两朝为官，郑成功的父亲，台湾郑氏王朝的开创者。
郑芝龙的一生，可以说精彩无比，比之各种穿越小说中的猪脚更像猪脚。
郑芝龙18岁时，与兄弟齐至澳门的舅父黄程处学习经商，并于澳门接受天主教洗礼，教名Nicolas，因此也被西洋人称作NicholasIquan（尼古拉·一官）。之后往来东南亚各地，后到日本九州，因习剑术，结识并娶了福建华侨铁匠翁翊皇的义女田川氏为妻。一开始追随于日本平户岛的华侨大海盗商人李旦门下，初时担任翻译等工作，逐渐成为李旦的得力助手。李旦过世后，郑芝龙逐渐接收其势力；1623年接收李旦的事业船队，经营合法生意，另一手则走私。
1624年中秋后，芝龙将事业重心自日本九州岛迁到台湾，归附“日本甲螺”（倭寇首领）颜思齐。此后不久，荷兰东印度公司登岛，驱逐了以台湾为基地的其他势力，郑芝龙遂携妻子定居于中国大陆。
1625年颜思齐死，芝龙结合诸海盗首领，号称十八芝，拥有当时福建沿海实力最强大的一支武力及商业团队，领导海贼数万人，经营走私与劫掠事业，横行于台湾海峡。当时泉州府同安知县写给福建巡抚的文书中说郑芝龙虽事劫掠，但对泉州百姓却是异常仁慈，不但不杀人，甚至救济贫苦，威望比官家还高。“所到地方但令报水（即通报官府踪迹），而未尝杀人。有彻贫者，且以钱米与之。”
1628年，受福建巡抚熊文灿招安，成为官员，率领原部，为明廷守备沿海以防海盗倭寇和荷兰人进攻，率军讨伐其他昔日结拜契兄弟海盗力量，包括李魁奇、钟斌，官至总兵。不久便返回福建泉州南安老家，成为当地首富，也是少数迎娶了日本人却仍能正式返回中国内地的海盗。
1633年芝龙于福建沿海金门海战击溃荷属东印度公司舰队，从此控制海路、收取各国商船舶靠费用，郑芝龙也因此迅速富可倾国。俨然称为闽南的领主与海上霸主，并对缴保护费给芝龙的商船（一艘大船需缴三千两银钱），给予郑家的令旗；如不缴费而想经过芝龙海域的，恐怕难逃被劫的命运。芝龙如此强横，使荷兰东印度公司营运不宁，荷兰人数度联合其他势力合取芝龙，但芝龙仍持续扩张其势力，并将荷兰人次次打败。
不久，郑芝龙应明朝廷要求，继续率军讨伐其他昔日结拜契兄弟海盗仅存最大股力量刘香，于虎门大获全胜，名震福建官至都督。不久福建省内发生旱灾，郑芝龙提议载饥民移民台湾，并给予移民十分优惠的资助条件，有人认为其为开创了大规模移民台湾之先河。
如果姬庆不出现，那么不久之后，南明弘光皇帝册封郑芝龙为南安伯，福建总镇，负责福建全省的抗清军务。
无论是左良玉，还是郑芝龙，都是姬庆收服的对象。左良玉，不值得一提。郑芝龙，可谓大材，不过，姬庆是不可能允许这股处于半独立的势力继续存在，他们必须接受大明朝廷的整编，改造为未来的大明朝海军。其控制的海上贸易，也要交给朝廷，设立海关，征收赋税。
当然，姬庆知道就算郑芝龙会同意，他的势力中的既得利益者，也不会同意的。利益之下，人是什么事情都会做出来的。
二是农民军集团。
现在除了京城外已经整顿完毕的李自成的大军外，剩下的就是以张献忠为代表的最大农民武装了。
崇祯十六年据武昌，称大西王。不久克长沙，宣布免征三年钱粮，从者愈众。
之后的历史，崇祯十七年（1644年）8月9日攻破成都，巡府龙文光，蜀王朱至澍及其嫔妃全部自杀身亡，其他官员当了俘虏。义军进入成都号称60万大军，很快控制了四川大部分地区的州、县，在成都，张献忠先号称秦王，接着宣告建立大西国，改元大顺。建立健全制度，后称帝，以成都为西京，8月16日登基皇位。
张献忠在四川确有许多难解之谜，最大的谜可能要算所谓的“张献忠剿四川”了。
近百年来有许多史学家都惊奇地发现，没有哪个四川人是土生土长的，几乎都是“湖广填四川”，从外省迁来的。明末清初，确实出现过人口大量骤减的事实。难怪当时的民谚这样说：“岁逢甲乙丙，此地血流红”，“流流贼，贼流流，上界差他斩人头。若有一人斩不尽，行瘟使者在后头。”难道真是张献忠把四川人杀光了吗？
清朝期间所编撰的“史料”以及一些“记录”等都把大屠杀的责任归于张献忠。由于清朝的统治延续了两百七十多年，以至绝大多数人都对此深信不疑。连鲁迅先生也曾批判过张献忠是“专在‘为杀人而杀人’”。
其实，只要仔细查看一下清兵侵入四川的那段历史，真相不难知晓。1646年，也即满清入关後第三个年头，满清即宣布张献忠已被战死，并宣称“破一白三十余营。平四川”，即宣布四川平定。
然而事实并非如此。满清攻陷渝城（重庆），是在十三年後的1659年。
因此对四川人民的这种顽强不屈的抵抗，清军采取了彻底屠杀的办法作为报复。即不论是“张贼”，还是无辜的平民，一律斩杀。
“民·贼相混，玉石难分。或屠全城，或屠男而留女”---这是1649年满清贴出的公告！！！！！！
这种残忍的镇压方式，在四川竟然持续了很长时间。为了隐瞒真相、欺骗中国人，满清居然把他们自己干的这些大屠杀全部栽赃给张献忠！
试想，假如张献忠真如满清鞑虏所宣传的那样，“是一个疯狂的杀人魔王。四川交通可达的人烟稠密之处，差不多被他杀绝”，那麽，几乎没有人烟的四川，何能抵抗十多年？
已经到了“弥望千里，绝无人烟”的地步，何需“劳驾”鞑虏们花费十多年时间去平定？
这不是明显的矛盾嘛。四川人民的反清活动被残忍地镇压後，的确是到了“弥望千里，绝无人烟”的地步。清廷不得不迁移湖广的人口至四川（即有名的以湖广填四川）。造成这种惨状的不正是鞑虏们吗？可见当时的鞑虏们不仅穷凶极恶、而且栽赃的手法也卑鄙至极。
当然越是夸张和宣传张献忠的“屠杀”，就越能证明真正的刽子手们的行为是“正义”的。这是小学生都知道的道理。满清统治了两百多年，战败一方的记录早就被毁灭或被篡改，留下的只是有利于自己的“记录”和当时的宣传，这样的“历史”代代相传，两百年後的百姓也就很自然地信了。
如上面的例子，还是可以从满清自己的记录里找到矛盾的地方，从而还回历史的真面目。也有後来的出土文物戳穿了当时满清所制造的、流传两百多年的谎言。
而姬庆后来对于张献忠部的探查，也证明了这一点儿，至少，张献忠不是个嗜杀之人。否则，人都杀了，谁还跟着他当兵？！人都杀了，赋税哪里来？光靠抢，就能称王称霸？
仙城降临、仙人临世，估计只有亲自看到的人才会相信吧。即使这个天大的信息很快传遍了全国，但是想让国内的人们都相信，那是根本不可能的。尤其是那些手中掌握着军队、半独立性质的势力，更是不可能依此就对京城那边束手就擒。
所以，收服的同时，遇到了抵抗，也有了清剿的需求。比如对于左良玉、郑芝龙、张献忠等等这样的势力集团，就必须如此。
好在，如果仙人真的出现在他们面前的时候，表现出刀枪不入或者各种匪夷所思的能力的时候，无论多么自信的人，也会有绝望之感。
于是，在姬庆派出的子体飞天部队的接触之下，左良玉、郑芝龙、张献忠等等大势力，都归降了大明朝廷，各项整编工作，也在进行当中。
就这样，在姬庆来到大明一个月的时间之内，除去满清外所有不受控制的势力都被扫荡一空，大明对于地方的统治也重新恢复了正常，各项改革措施、新的制度也在进行当中。
大明的未来，会越来越好。