现在，周宪章真正成为了大清国的封疆大吏。在大清国的地方督抚大员中，最为显赫的有三个职位：直隶总督、两江总督和湖广总督。台湾和朝鲜原本不设总督，台湾隶属于闽浙总督的管辖范围，朝鲜是一个半独立王国。而现在，由于周宪章手握大清国最为强大的军队，台朝总督的地位，与直隶总督不相上下，成为最为显赫的地方大员，其地位，甚至在湖广总督张之洞之上，仅次于直隶总督荣禄。
周宪章独霸一方，不管是太后老佛爷还是光绪皇帝，都是如芒刺在背。只有一个人心里偷着乐。
这个人就是袁世凯！
冬天来了，白雪纷飞，在山西老家赋闲的袁世凯，整天披着蓑衣，在河边独钓寒江雪。他心里明白，周宪章的崛起，使得朝廷越来越离不开他了，用不了多久，朝廷就会请他出山！
到那时候，他要向朝廷提出更多的要求！小站新军十个镇，必须要达到章军的兵力，装备也不能弱于章军，否则，朝廷拿什么与章军对抗！
袁世凯有十成把握，朝廷会答应他的要求！
到那个时候，制约朝廷的，就不是章军，而是小站新军！章军再强大，也远在台湾朝鲜，而小站新军，就在北京城下！
袁世凯心里十分清楚，大清国已经到了山穷水尽的地步，现在，到了用实力说话的时候了！
小站新军虽然丢了冯国璋的一个镇，但是，王世珍、段祺瑞那些经历过甲午战争的官兵们，心中只有袁世凯，他们早就对朝廷失去了信心，而对袁世凯充满了希望！只要袁世凯一声令下，这些人就会跟着他勇往直前！
按下袁世凯不表。
且说，张萌桓向周宪章颁旨毕，盛宣怀又拿出一道朝廷的敕命来，宣布朝廷对章军官兵和台湾地方官员的封赏任命。在这之前，周宪章以总理衙门大臣和湖广提督的名义，向朝廷上书，保举台湾和朝廷两地地方和军事官员。朝廷的这倒敕命，基本上就是周宪章上书的翻版，朝廷也明白，到了这个时候，只要周宪章承认大清国朝廷对台湾和朝鲜的主权，其他的，只能任由周宪章行事。
按照朝廷的敕命，章军弟兄各有封赏：
洋鬼子汉纳根，按律不能获得实职，赐一品顶戴，双眼花铃，赏黄马褂，赐尚书衔。
刘永福，授台湾巡抚。
朴永烈，授朝鲜巡抚。
韩令准授平壤总兵，兼安州知府。
罗鸣芳，授台湾提督。
冯国璋，授朝鲜提督。
清朝管制，提督品级在总督之下，是总督的属官，但提督与总督的辖区是一致的，周宪章为台朝总督，那么，就应该有一个台朝提督，总管台湾、朝鲜的军事。不过，台湾和朝鲜相距甚远，一个提督不便掌控，周宪章打破常规，在两地分别设置提督，分别掌管两地的军队，朝廷也就听之任之。
那哈五身份特殊，接替周宪章，授湖广提督，并授兵部尚书衔，官居一品，这是遥领授职。光绪皇帝对这位皇叔，还是极为看重，他心里还指望着那皇叔辅佐他的皇位。
姚喜授副将。
吴佩孚授台北总兵，加兵部侍郎衔。
张作霖授彰化总兵。
张勋授台南总兵兼知府。
郭二杆授台中总兵。
蔡挺干授海军提督，领海军大臣衔。
李国革授澎湖知事，授总兵衔。
丁汝昌原本就是北洋水师的提督，擢升为海军提督，授兵部侍郎衔。
此外，盛大年和钱有贵均授户部侍郎，在台北效力。丘蓬甲授台湾布政使，吴彭年授台北知府，孟侬授彰化知府。其余章军官兵，各有封赏，将官升三级，士兵赏银五百两，阵亡将士家属由朝廷抚恤，赏银一千两，并免五年赋税。
周宪章代表章军官兵领旨谢恩。
其实，章军官兵和台朝两地的官员们，对于朝廷的封赏毫不在意，在台湾和朝鲜，朝廷的官衔已经没有什么实际意义了。周宪章早已任命了两地的军政官员，官员们也早已走马上任。接受朝廷的封赏，其实是给朝廷一个面子。
周宪章在任命各地地方官的同时，对章军进行了整编。将章军整编成了两个军。章军设司令部，周宪章自认章军总司令，罗鸣芳为副司令，汉纳根为参谋长兼训练总监，小贩出身的钱有贵，因为前段时间的出色表现，被任命为章军司令部情报部部长，负责间谍活动。
台湾章军陆军整编为第一军，军长那哈五，副军长吴佩孚。第一军下辖三个师和一个独立旅，第一师师长吴佩孚兼任，第二师师长佟蔚，第三师师长张作霖。驻琉球的独立旅，扩编为章军第四师，归第一军管辖，师长郭二杆。
此外，张勋的直属旅，仍然为章军司令部直属旅，由周宪章直接调度。周宪章知道，张勋的部队能打仗，不过，得把张勋这小子看严实了，这小子稍稍松活一点手脚，就要闹出点事。
朝鲜章军陆军整编为第二军，军长朴永烈，副军长冯国璋。下辖两个师，第五师师长韩令准，第六师师长由冯国璋兼任。
章军设海军司令部，海军司令蔡挺干，副司令丁汝昌。海军下辖三个舰队，其中，第一舰队以镇远为旗舰，以澎湖为基地，由蔡挺干直接指挥。第二舰队以定远为旗舰，以基隆为基地，由丁汝昌指挥。第三舰队为朝鲜支队，程璧光为舰队司令，以仁川为基地。此外，李国革的海军陆战队扩编为一个师，驻扎在澎湖。
经过整编，章军陆军总兵力为两个军，加上司令部直属部队，总兵力8万，大炮五百门。海军三个舰队，拥有巡洋舰十二艘，炮舰二十艘，鱼雷艇八艘，其他舰船十艘，共有各类舰船四十艘，加上海军陆战师八千人，总兵力达到了三万人。章军成为了一支令人望而生畏的力量。周宪章真正成了一方霸主！
同时，在台北成立武备学堂，周宪章亲自担任校长，罗鸣芳为常务副校长，汉纳根为教务主任。这座完全西式的军事学堂，担负着为章军提供后备人才的任务。周宪章规定，章军营、连、排军官，全部都要到武备学堂受训，这些军官大部分是打出来的，临战经验是有的，理论知识严重不足，经过训练，战术意识大为提升。
周宪章的老朋友，德国人艾德，受邀来到台北，担任台北武备学堂的总教习。艾德把他的德国同行都带了来。台北武备学堂人才济济。