吕布正在恼怒，忽然长安城中飞马来报，说是张济、樊稠两路军马进犯长安，京城危急，命吕布撤军。
闻听长安有失，吕布领军便走。背后李傕、郭汜合兵一处领大军杀来。吕布无心应战只顾奔走，折了好些人马。待到长安城下，只见樊稠、张济兵马云屯雨集，围定长安四面。吕布一马当先，便与樊稠、张济交战，贼兵四门人马汇集一处阻截吕布回城，此时李傕、郭汜又引兵从背后杀来。
吕布腹背受敌陷入险地，麾下士卒一路狂奔到此也没了体力，多有叛逃投降者。吕布见战事不利，不敢再与李傕等人的大军交战，引着残兵杀出一条血路才来到了长安城边。
适才为了与吕布争锋，围城的樊稠、张济已然调走了四门兵马，此时城上守军见吕布突围而来立刻开城将吕布放入城中。
李傕、郭汜等人怎会让吕布兵马轻松入城？死死在后追赶。城上守军害怕城门失守，急忙关闭城门。吕布兵马有一大半跑得慢的都没能入城，最后追随吕布入城的兵马还不足出征时的十分之一。
王允、吕布这回算是坐困愁城彻底抓瞎了。唯一值得安慰的便是城中还有些许人马，长安城又坚固高大，没有让李傕、郭汜等人马上攻进城来。
吕布有勇无谋，望着城下密密麻麻的十万大军除了皱眉也别无他法。王允更是六神无主，一会儿后悔当初应该赦免李傕、郭汜等人，一会儿又后悔不该赶走了南烨法师。可惜他悔来悔去也于事无补。
长安城中主管军政大事的两个人都慌了手脚，可想而知城中百姓有多么惊恐了。长安百姓都没想到，残暴的董卓死了还不到两月，长安就又遭兵灾匪患。此时百姓们都羡慕起那些跟随南烨法师前往交州的人了，也开始后悔自己当时没有离开长安，现在想走也走不掉了。
数日之后，董卓余党杨定等人在城中为内应，偷开城门，四路人马一齐拥入。吕布挥兵左冲右突，拦挡不住，只身引数百骑往青琐门外，呼王允道：“贼势浩大！请司徒上马，同出关去，别图良策。”
王允道：“辅保社稷，国家安泰，我之愿也。若不能得偿所愿，则允献身而死可也。危难临头苟且偷生，我不为也。将军替我谢关东诸公和光华法师，努力以国家为念！”
鸟之将死其鸣也哀，人之将死其言也善。王允一心除掉国贼董卓其人本性不坏，只是被胜利和权利冲昏了头脑，又没有足够的能力去守护这风雨飘摇的大汉江山罢了。
吕布再三相劝，王允就是不肯离去。片刻之后，长安各门火焰冲天，吕布只得弃了王允，引百余骑飞奔出关，投袁术去了。
李傕、郭汜入城之后纵兵大掠。太常卿种拂、太仆鲁馗、大鸿胪周奂、城门校尉崔烈、越骑校尉王颀皆死于国难。长安百姓见贼兵入城烧杀抢掠纷纷逃出城去，这些无家可归的百姓聚在一处商议，不如趁着南烨法师离开长安不久，追随法师一路南下，或许还能赶上。就这样，数十万百姓聚在一处开始向南进发。
西凉兵马在城中横冲直撞，四处劫掠，眼看就到了皇宫内院。朝臣无力阻止乱兵，为今之计便是指望天子威严可以震慑群贼。于是群臣便请献帝刘协上宣平门止乱。
虽说大汉江山已然处在崩溃边缘，各路诸侯也不把年幼的刘协当回事。可是对于普通百姓来说，天子还是那个天子。便是李傕等人的乱兵见了刘协的明黄伞盖也不敢轻举妄动，纷纷在宫门外住了手。
李傕、郭汜等人远远望见天子仪仗赶忙约束军士，口呼“万岁！”
献帝刘协自打北邙山开始就没有过一天安生日子，不是遭遇乱兵，就是提心吊胆害怕步哥哥刘辩的后尘。经历了这么多事情之后，刘协的胆子也练出来了，倚靠在门楼上问李傕等人道：“众卿不奏不请，闯入长安，意欲何为？”
李傕、郭汜仰面奏道：“董太师乃陛下社稷之臣，无端被王允、南烨、吕布三人谋杀，臣等特来报仇，非敢造反。但见此三人，臣便退兵。”
南烨、吕布早就撤了，此时只有王允在刘协身边，闻听此言便道：“臣本为社稷除贼。事已至此，陛下不可惜臣之命，以误国家。臣奏请见此二贼。”
献帝刘协徘徊不忍，王允便从宣平门楼上直接跳下。这宫墙不及城墙的一半高，只有数米，王允跳下宫墙也未受伤。大呼道：“法师、奉先已走，老夫王允在此！你等反贼有何话说？”
李傕、郭汜拔剑怒道：“董太师因何罪被你诛杀？”
王允面色不变道：“董贼之罪，弥天亘地，不可胜言！受诛之日，长安士民，皆相庆贺，唯独你等不闻乎？”
李傕、郭汜狡辩道：“即便太师有罪，我等又有何罪？偏偏不肯相赦。”
王允大骂道：“董卓一人就算作恶又能行多少恶事？百年三万六千日，老贼就算日日作恶也不过害人三万，而这天下受董贼之害者又岂止三万？洛阳、长安百万生民，大汉天下万万百姓皆受其害，还不是皆因你等爪牙厉害助纣为虐！如今你等逆贼何必在此多言抵赖？我王允今日唯一死而已！”
李傕、郭汜被王允骂的面红耳赤，二人手起刀落，将王允杀于宫门之外。后有史官赞王允道：“王允运机筹，奸臣董卓休。心怀家国恨，眉锁庙堂忧。英气连霄汉，忠诚贯斗牛。至今魂与魄，犹绕凤凰楼。”
二人杀了王允还不罢休，又命人将王允宗族老幼，尽皆杀害，女子尽数卖为姬妾，朝臣百姓闻之无不落泪。李傕、郭汜杀得兴起，忍不住寻思：“既然到了这般田地，何不杀了天子取而代之？”
献帝刘协也真是多灾多难，刚脱离董卓魔爪，又落入李傕、郭汜手中。正可谓：巨魁伏罪灾方息，从贼纵横祸又来。就在刘协危在旦夕之时，贾诩领张济、樊稠劝谏道：“天子不可擅杀！我等才入长安，人心不稳。今若杀了天子，众怒难平，天下反矣。不如仍旧奉之为主，假传其令，慢慢诱各路诸侯入关，先去其羽翼，然后杀之，天下可图矣。”
李傕、郭汜听从贾诩之言还从未吃亏，他们今日能兵进长安也多亏贾诩之计。二人按住兵器压住杀意，来见刘协。
献帝刘协被李傕、郭汜吓得够呛，他可是亲眼看着二人挥刀乱砍将王允剁得血肉模糊。见二人到来便颤声问道：“王允既诛，法师、吕布又不在城中，你等军马何故不退？”
李、郭二人道：“臣等有功王室，未蒙赐爵，故不敢退军。”
刘协闻言叹了口气，他想起王允、南烨诛杀董卓之后都不敢居功，没想到李、郭二人攻占长安逼死王允反而自称有功，这要多厚的脸皮才行啊！只是刘协身在矮沿下不敢不低头，只好问二人道：“众卿欲封何官何爵？”
李傕、郭汜、樊稠、张济四人各自写职衔献上，索要如此官品，刘协只得从之，一一下旨封官。李傕为车骑将军池阳侯领司隶校尉假节钺。郭汜为后将军美阳侯假节钺，同秉朝政。樊稠为右将军万年侯。张济为骠骑将军平阳侯，领兵屯弘农。其余人等，各为校尉。李傕等人这才谢恩，收拢乱兵退出城外安营。
因为李傕、郭汜等人是打着为董卓复仇的旗号而来。如今攻占了长安便下令追寻董卓尸首。董卓早被点了天灯，又被万人践踏，哪还有什么尸身？最后只获得些零碎皮骨。李傕等人只好以香木雕成形体，安凑停当，大设祭祀。又用王者衣冠棺椁，选择吉日，迁葬郿坞。
临葬之期，天降雷雨，平地水深数尺，霹雳震开其棺，尸首震出棺外，零皮碎骨皆散落水中无处找寻。百姓深恨董卓，便有传言董卓为天所怒，皮骨皆被雷火消灭。若不是董卓挖坟掘墓窃取了南烨法师的星宿紫霞霹雳仙衣，早该被五雷轰顶而死。
就在李傕、郭汜攻占长安的时候，南烨已然到了荆州地界。一日深夜，守营士卒来报，营外有一人身穿百姓装束，说是法师故人，听闻法师到此，特来相见。
南烨还以为是刘表又派人来协助百姓渡江了，便让士卒将人请进帐中。南烨一看还真是故人，不过却不是刘表的人，而是孙坚四亲将之一的祖茂，祖大荣。南烨知道刘表与孙坚不合，便问祖茂道：“大荣因何乔装改扮深夜至此？”
祖茂一见南烨尚未言语眼圈先红了，哽咽道：“法师，我家将军故去了！”
南烨早知道孙坚命不久矣，诸侯讨董之时便将孙坚的将星取了。可是没想到孙坚这么快便亡故了。就算南烨对于孙坚的死早有准备，也还是有些伤感，毕竟二人有些交情，一直都是盟友。