为了管理矩阵的需要，也为了应对可能存在的隐患，机器文明逐渐形成了如下几个相互独立，又相互联系相互牵制的部分。首先是几乎为单一意识（对应于黑客帝国第三部《矩阵革命》中与尼奥谈判那个有大量机器章鱼组合而成的机器大帝）控制的矩阵外部机器世界；其次是控制个体意识出入矩阵的西格马向量（VectorSigma，即上译版中的魔力神球）；再次是负责对矩阵信息进行管理并升级的oracle（对应黑客帝国里的先知），最后是能用来紧急中断塞伯特恩星球的除了四大核心之外的一切机器活动甚至把他们都重新格式化的等离子能量室。
我们可以推测在初期，代表机器文明本体，控制矩阵外机器世界的那个核心意识拥有西格马向量的钥匙，从而也就控制了决定矩阵内部的特定程序出入矩阵的权力；而西格马向量的钥匙本身具有能把有机生物转化为纯金属形态的能力，塞伯特恩之所以是后来我们所看到的那个表面以及内里大部分都是金属形态的星球，很大程度上可能就是动用西格马向量钥匙的结果。甚至连塞伯特恩的名字Cybertron本身也是这个星球金属化后重新取的，这也是为什么在G1动画中西格马向量说它在塞伯特恩之前就已经存在。
西格马向量及其钥匙是变形金刚几大核心中最早明确出现在动画里的设定。在G1动画的第56，第57集《TheKeytoVectorSigma》（1）（2）中我们就已经见识了它们的力量。正是通过西格马向量，威震天和擎天柱按照各自的要求从矩阵内把一些具有独立个性的意识（其实也就是火种）引入到他们新制造的机器人躯体之内，从而诞生了飞虎队和飞行太保两对组合变形金刚。
Oracle是对矩阵负责的AI程序，不仅表现在负责矩阵的不断升级，也表现在它拥有矩阵主要信息的数据库，并且适当时候能向矩阵外的机器文明传导矩阵内部的动态和主流意志，成为沟通矩阵与矩阵外机器之间的桥梁。不仅如此它本身也储存了西格马向量钥匙的信息代码，以及启动等离子能量室的钥匙代码。oracle除了在决定矩阵升级的事务上有自主决定权之外，在其他事务上自主决定权很小，所以尽管oracle拥有控制西格马向量的钥匙，但它本身并不能使用这个钥匙，但oracle确实拥有启动等离子能量室的权限。此外oracle本身也可以看成是矩阵内的一个个体意识，尽管是一个特殊的个体。
如果说西格马向量的钥匙是机器文明对付有机文明可能的威胁而准备的利器。那么等离子能量室则是机器文明为了预防矩阵之外控制机器世界的单一核心意识自身发生危险变异而自我毁灭甚至累及矩阵而提前准备的预防措施。动画片里最早出现等离子能量室应该是美版紧接着95集之后的THEREBIRTH的三集中，但那里仅仅是初露端倪，而到了猛兽侠的第十三集《终点》，等离子能量室才真正大显威力。在霸王龙（英文原名同威震天Megatron）获得并复制了大批西格马向量的钥匙，黑猩猩（OptimusPrimal）得到了圣贤oracle的授权，具有了启动等离子能量室的能力。在霸王龙把黑猩猩同伴一个个都纯金属化，乃至黑猩猩自己也被打败被金属化的时候，最后关头启动了等离子能量室，结果一瞬间就扭转了局势，被霸王龙控制的整个塞伯特恩星球的机器人部队都停止了运转，霸王龙自己的金属身体也被粉碎。而被金属化的巨无霸则恢复了生物变形形态。
从以上的几个设定来看，机器文明为了防备潜在的隐患，形成了矩阵、管理矩阵的机构，以及矩阵外的机器文明本体，三足鼎立，相互制衡相互约束，同时又相互依托相互推动的一个体系。
但是这种防范制衡体系，并没有能使机器文明高枕无忧，顺利地在最初设定的轨道上发展。在大的隐患爆发之前，其发展就已经陷入了比例失衡、主客颠倒形势之中。本来矩阵的设立不过为机器文明服务，是机器文明自我进化的一个工具。但由于矩阵的特殊性质，矩阵内部成为丰富多彩充满个性意识的世界，而矩阵外部的机器文明本体成为一个几乎是单一意识的呆板僵滞的世界；矩阵内部成为充满活力与进步，决定整个机器文明前进方向与力度的文明发动机，而机器文明本体反倒成为被矩阵牵着鼻子走的仆从。矩阵世界的重要性变的越来越大，地位也越来越高，占据的资源也越来越膨胀，而矩阵外部的机器文明本体似乎反倒成了一个私有若无的附属品。
由于矩阵世界的高度拟人类社会化，还由于矩阵本身的人类起源，生活在矩阵世界的个体意识，会有相当一部分甚至一半以上的个体意识，，其思维方式和感情倾向完全是人类化的，甚至以有机智能生物的继承者自居。尽管它们赖以存在的物质基础仍旧不过是机器文明的硬件上运行的智能程序而已。当然与此对应，在矩阵内部同样也会有相当一部分的个体意识会以机器文明的体现者和捍卫者自居。
这种形势不断发展下去导致的结果就是矩阵最终在某个临界点摆脱了外部机器世界的约束，机器文明的发展由此又来到了一个转折关头。而这个临界点，首先矩阵赖以存在的物质基础的改变，其次是火种接口的出现和矩阵接口的出现。关于前者，暂且先不做讨论，先说后者。
ps，摘自多年前看过的“杜车别”的网络文章，主要用来说明猪脚未来对于天网发展的设定，这对猪脚的未来发展极为的重要，看过的可以略过哈！。