赵敏和张无忌退走不久，庄铮等五行旗高手回到军营，在火坑之处跟吴劲草了解完情况，又与冯国胜、常遇春等人率军向四周搜索无果，遂作罢，只日夜督促浮桥工程。
连续几日张无忌独自出动，骚扰华军大营数次，均被五行旗众高手阻止，虽然烧了华军一些浮桥构件，终归无法完全阻拦，赵敏无奈撤走，到虎牢关与李思齐汇合，汇合元军严防虎牢关。
大华兵临虎牢关，两军对峙，各武林门派为了争功劳，各自派出高手，在虎牢关附近查探消息。
赵敏和张无忌商量对付大华的方法。赵敏受到前几次偷袭烧毁浮桥构件成功的启发，决定带领高手，潜入大华腹地捣乱，让大华后勤吃紧，无力进攻。两人商量间有人传话，元朝皇帝特使卫王宽彻哥到了，传赵敏张无忌听令。
两人到了李思齐衙门，却发现里面埋伏有军士，杀气弥漫，张无忌示意赵敏，赵敏却不以为意，径自入内。太监要传令，要拿下两人，刀斧手冲出。
张无忌正要动手之时，外面传来喝止声，另一个特使也先不花和李思齐赶到，先拿下宽彻哥，再向赵敏解释，原来宽彻哥的几个妻舅在元国新帝夺宫之夜被赵敏手下杀了，特地寻了机会混入钦差队伍中，途中借故离开快马加鞭来找赵敏报仇，也先不花发觉不对劲后赶来制止。
也先不花用马奶酒为赵敏、张无忌压惊，和赵敏、李思齐说起朝廷情况。元国新帝登基后受到颇多制肘，山西的脱列伯、河北的张良弼、孔兴，以及奔逃到甘肃的前湖广行省平章政事答失八都鲁之子孛罗帖木儿，四人对新皇帝心怀不满，结朋为党，推举孛罗帖木儿为首领，拥军二十余万却不听朝廷号令，又屡屡联络太上皇旧党，似乎有清君侧的打算。
也先不花又提起赵敏一家自祖辈起为大元立下功劳，忠心耿耿，要请赵敏再为大元尽一份力。
赵敏便将自己要潜入大华腹地捣乱的打算拖出，说虎牢关有李思齐把守，想必不会出问题，只要机会合适，可以从风陵度口反攻大华，重新夺回奉元，将史应龙困在洛阳。也先不花辩驳说军国大事，小诡计并没有什么用处，现在大华实力强盛，已经不是仅凭奇兵能战败的了，必须统筹全局，举国之力才能与之较量。
也先不花眼见时辰已到，终于说出皇帝的打算，却是要求赵敏充当公主侍女陪嫁孛罗帖木儿，以收拢孛罗帖木儿联盟的二十余万兵马，好统筹全局，平定天下乱兵。
赵敏大怒不已，立马发作，却发现自己已经中了十香软筋散。也先不花叫人入门听侯命令，却是护国仁王寺五大金刚上师，其中两个曾在襄阳城出现过，对赵敏恨之入骨。张无忌这才发现不对，也发现自己中毒了。
原来赵敏、王保保因为提倡蒙汉一家之说，多年来鼓动支持大元封赏各地镇压汉人起义的官府“义兵”，分薄了蒙古贵族的权利，一直遭到激起蒙人贵族反对。
又因为赵敏先前大肆掳掠五大派，激起各地汉人反弹也被揭露，再加上王保保身亡，汝阳王直属兵力已经被大华所灭，汝阳王一系实力骤降，太上皇旧党更是在竭力攻击。新帝为了安抚蒙人贵族，革除了汝阳王的丞相职位，剥夺所有权力，带罪待议。.
而且面临大华咄咄逼人之势，众多蒙古贵人以脱脱为首，向新帝建议，派人向各大汉人起义势力求和，应该许以重利和头衔，并辅以各种手段挑拨离间，静待汉人各个大势力互相斗争，坐收渔人之利。
另外又有太上皇旧党说赵敏多次得罪大华，应当抓捕献给史应龙赔罪，以便求和。汝阳王激烈反对后，却被本系人马提出让赵敏陪嫁与孛罗帖木儿，用以安抚蒙人内部势力，遭此背后一刀，汝阳王再无反对之力。
元新帝任命御史大夫也先不花为钦差总领，准许便宜行事，一定要与大华停战，并派出其他数支钦差队伍，分赴各地，对郭子兴、刘福通、毛贵、张士诚、陈友谅、朱元璋等等各大势力加以拉拢挑拨。
护国仁王寺五大金刚上师一进门，赵敏立即醒悟过来，知道中了计中计，先前宽彻哥的只是为了降低她的警惕，也先不花的下在马奶酒中的毒药才是撒手锏。事已至此，赵敏临危不乱，一面暗中沟通张无忌，一面竭力拖延时间。
赵敏说自己还有掌控蒙人祖庭哈拉和林的外公奇力兀穆尔在，新帝不可能轻易放弃汝阳王一系。也先不花说奇力兀穆尔老了，一个月前逞强猎狼，从马背上跌了下来，已经死了。如今掌管哈拉和林的是赵敏堂舅嗒力赤苏尔。嗒力赤苏尔一向与汝阳王不和，已率领哈拉和林一众部落向新帝效忠，并且汇聚了五万精骑南下帮助元廷平乱。赵敏又提自己和哥哥王保保与新帝自幼相识，情同兄妹等等诸事，却被也先不花纷纷驳斥。
眼见赵敏已经把话题说完，气氛越来越僵，张无忌虽然还未将身上毒素驱除干净，却也不敢继续拖延，当即暴起救人，背着赵敏意图挟持也先贴木儿，却五大金刚上师所拦住。情急之下别无他法，张无忌不得不带着赵敏向南逃遁，路上遭遇也先不花先前落下的番僧护卫阻击，逃出不到二十里路就被五大金刚上师追上。
张无忌身上余毒未清，独力对抗大护国仁王寺五大金刚上师，使出乾坤大挪移苦苦支持，边逃边战。激斗中赵敏背部被打中，重伤昏迷，此时风云三使再次出现，上前帮助张无忌，并发出信号招呼援兵。
原来风云三使上次从汝阳王府逃脱后，直接回西域波斯明教总部，向诸位护教法王回复中原所行结果，得知紫杉龙王及乾坤大挪移下落的十二波斯明教宝树王立即动身赶赴中原，打前锋的风云三使认出张无忌武功来历，这才出手相助。
波斯明教众人围攻五大金刚上师，五大金刚上师结阵自保，并以语言喝骂波斯明教众人不知死活，敢干涉元朝廷捉拿钦犯。波斯明教众人对五大金刚上师的话置之不理，几位护教法王见风云三使和其他属下一时拿不下对方，于是加入战战团。
张无忌见到十二宝树王的武功，记起之前赵敏从圣火令拓下并翻译好的武功口诀，领悟圣火令武功，他对伤了赵敏的五大金刚上师痛恨不已，眼见赶来加入战斗的蒙人高手越来越多，当即加入战团，以圣火令武功迅速击杀五大金刚上师。
张无忌和波斯明教众人谈判，双方迅速取得一致意见。张无忌以乾坤大挪移为代价，请明教总坛高手护送自己回武当山。张无忌先交出前三层乾坤大挪移心法，打扮成色目人混在波斯明教教众中向南逃走。
四大派眼线传回张无忌和赵敏被元军追捕的消息，一路沿途截击。正所谓人为财死，鸟为食亡，五大派许下重诺，江湖人士纷纷响应。一时间张无忌成了过街老鼠，人人喊打。张无忌虽然已经扮成波斯人，以面巾覆脸，混在波斯明教总坛诸人的队伍中，却仍被武林中人辨认出来，一路连遭拦截，虽然杀伤不少人，但汇聚而来武林人士却越来越多。
太室山下张无忌遭遇少林寺僧人拦截，抛下波斯明教人马，遁入嵩山，赵敏伤势发作，张无忌找地方先帮助赵敏稳住伤势，又驱散十香软筋散毒素，让她能用内力自主疗伤。
少林寺一百零八罗汉大阵困住波斯明教高手，常胜宝树王以激发生命潜力为代价，带人闯出大阵，也逃入山中，一路冲杀离开中原，返回波斯。少林寺汇合后面赶来的四派高手封山搜索。
元使也先不花派人追缉赵敏之后，也不等侯结果，直接带人赶到洛阳，与大华谈判。史应龙接见了也先不花，却拒绝与大元和谈。也先不花临走前赠送史应龙一对美貌双胞胎新罗婢女，王难姑一眼看出这两个新罗婢女身怀奇毒，一旦有人享用了这种阴毒女，便会身中奇毒，日后毒发身亡。王难姑当即把人要走，并派人告诫暗中投靠了大华的方国珍。
大华虽然没与接受也先不花的和谈建议，但为了消化地盘，休整军队，没有继续向前进军。史应龙得到赵敏和张无忌被困太室山的消息，率领三千精锐骑兵赶到太室山。
殷野王趁史应龙离开之际混入洛阳，设法引阿离到了城外一破庙，想要和阿离和谈，获得大华势力的帮助。
原来脱脱大军攻打日月教，殷天正重伤无法视事，冷谦代理日月军事务，但殷野王却暗自不服，为了争夺日月军大权，暗中联络毛贵。毛贵提出要迎娶一见钟情的殷素素，殷野王立即答应，转而去劝说殷素素，但遭到殷素素严厉拒绝，无奈之下，殷野王只能先将殷素素拿下囚禁，另用诡言安抚住毛贵，又赶到洛阳想获得阿离帮助。
阿离恨殷野王入骨，又怎么肯帮助对方，当场拒绝并斥骂殷野王忘恩负义，薄情寡义。殷野王恼羞成怒，对阿离下杀手。阿离武功大进，严防死守之下，殷野王无法迅速取胜。激斗中白龟寿突然现身，以蛤蟆功偷袭殷野王，一掌将殷野王打得心脉尽碎。
白龟寿与阿离见礼，叙说往事。当年阿离外祖与殷天正相识与西域，两人义结金兰，共同赶赴东南建立天鹰教。天鹰教成立之初外敌不断，有一次殷天正遭遇强敌伏击，阿离外祖父赶去救援，救奋战之下终于击退强敌，但阿离外祖父为了救殷天正身受重伤，医药无效去世，临终之前把阿离母亲托付给殷天正。
白龟寿身为西域白驼山庄总管，掌握了白驼山庄在天鹰教中的部分势力，在阿离外祖父身亡之后，为了保护阿离母亲，一直小心行事。后来阿离母亲嫁给殷野王，白龟寿对殷天正一家的提防稍有放松，又接到主持王盘山扬刀大会的重任，欣喜不已，还以为自己枉做小人了，等遇到谢逊抢夺屠龙刀，才想明白殷天正准备将天鹰教内所有忠于欧阳家的人借机铲除，实行借刀杀人。
王盘山扬刀大会上白龟寿仗着白驼山秘传内功装晕活了下来，将消息传给阿离母亲。阿离母亲虽然开始怀疑，但此时欧阳家已经再无力对抗殷天正，她又已散功，再无法可想，唯有叮嘱白龟寿小心保重。白龟寿就此躲了起来，等他避过风头返回天鹰教时，阿离母亲已经被逼死，小主人阿离也失踪。
白龟寿忍辱负重苦练白驼山庄秘传蛤蟆功，并暗中联络白驼山庄旧部，小心保存实力。这次他得知殷野王要来找阿离，暗中跟随，离开前给身负重伤的殷天正下了蛇毒，并且一掌拍死了胡青牛，断言殷天正再无人可救。殷野王听完白龟寿之话后惊怒交加，悔不当初，当场死不瞑目。
阿离带着白龟寿离开破庙，暗中保护阿离的蓝澜现身，自言白龟寿杀了胡青牛倒也省了她跑一趟的时间。返回洛阳王宫途中白龟寿介绍白驼山庄旧部势力分布，阿离想到周芷若有明玉珍、常遇春的支持，也不甘示弱，让白龟寿赶回日月教，暗中拉拢教众，等候时机行事。
史应龙赶到太室山下，指挥四大派高手并大军布下天罗地网，一路搜山。张无忌藏在峻极峰上帮助赵敏驱散毒素疗伤，发现大队人马搜山，情况不妙，但赵敏伤势极重，不能遭受震荡，只好继续隐藏，想等她伤势好一些再走。
搜山继续，半个月后，逃出囚牢的殷素素赶到，夜见史应龙求情，史应龙只答应保张无忌一命，殷素素问到底是怎么个一命法，史应龙默不出声。殷素素提起宋青书也保住了一命，不过却成了经脉尽断的废人，当场怒骂史应龙无情，但史应龙只是不答应尽力。
殷素素无奈之下说自己已经为史应龙产下一子，如果史应龙答应救下张无忌，就把这个孩子交给史应龙抚养。史应龙见殷素素拿自己的孩子来交易，怒不可竭，把殷素素赶走后却又想殷素素的话到底是不是真的，如果是真的该怎么办。
峻极峰上，赵敏伤势终于稳定，并且醒了过来。赵敏问张无忌近日情况发展，得知详情之后连骂张无忌糊涂，不该南下，而是应该和波斯明教众人北上，避开中原武林的围堵，找个好地方当作基地，以待来日卷土重来。
赵敏信心满满地计划着，两人应当北上前往东察合台汗国，然后西行至伊儿汗国。先在伊儿汗国稳定下来，然后在内战纷乱的国浑水摸鱼，凭借两人的武功和智计，当能迅速控制伊儿汗国，然后迅速向东吞并已有内乱征兆的东察合台汗国，再向北发展，吞并或联合钦察汗国，集合蒙古三大汗国之力再度南下，当能报得今日之仇。
张无忌想到如今两人成为中原武林公敌，纵然回到武当，恐怕也要连累武当派，一个应对不当，说不定就是个举派俱灭的后果，如果按照赵敏的计划，至少也要在西域奔波二十年，有这二十年的时间，说不定她就放下这段仇怨了，而且离开中原也能避免武当派左右为难。
二人商议已定，张无忌背着赵敏凌晨突围，不料两人才从山洞出来，就被青海派驯养的鹞鹰发现，青海三剑和几位青海派高手迅速赶到峻极峰下纠缠，其他各派高手纷纷赶到。
赵敏用语言挤兑各大派，终于取得各大派承诺，由张无忌独斗各大派高手。张无忌将赵敏放在一边，易容过得殷素素要上前照顾赵敏，但史应龙还弄不明白殷素素之前说已经为他生下孩子的事情是真是假，不敢放人过去，当下点住殷素素穴道，让其呆在身边。
张无忌一人先后打败青海派、崆峒派的高手，又苦斗何太冲夫妇、华山二老的正反两仪阵，苦苦相持大半时辰，趁着班淑闲内力已竭之际终于击败四人。少林派三度上场，赵敏担心张无忌力竭，当即出言讽刺各大派车轮战，少林派允许张无忌休息，空智送上小还丹以示磊落。
太室山脚处，张三丰率领武当七侠出现。武当派众人之前港湾西域夺取黑玉断续膏，好不容易得手回到中原，得知张无忌的消息，在玉门关汇合原本镇守武当的俞莲舟、殷梨亭又日夜兼程赶到太室。众人才要赶去峻极峰，却发现前面有人挡路，张三丰、俞岱岩、殷梨亭认得真实王启年。
王启年当日藏好武功秘籍后前往武当派，一招之间拿下留守的俞岱岩和殷梨亭，才知道张三丰带着其他五个徒弟去西域给徒孙宋青书找药，错失良机。王启年在武当山守候多时，不见张三丰归来，又得知张无忌的消息，便先行到太室山守株待兔。
张三丰不顾与王启年叙旧，让七个徒弟结成真武七截阵围住王启年，自己赶向峻极峰。王启年欲追赶张三丰却被武当七侠阻拦，当下一人施展北斗七星阵，以阵破阵。真武七截阵名不副实，十余招间被王启年破去，武当七侠被打得不要不要的。
王启年纵声传音，让张三丰选择救七个徒弟还是救一个徒孙，张三丰无奈半路折回，王启年放走武当七侠。张三丰让七个徒弟赶去峻极峰，叮嘱不可伤人，先稳住局面等他赶到再说。
峻极峰下各派高手听到王启年传声，一边惊骇王启年的内力深厚，一边又担心张三丰赶来救走张无忌与赵敏，空闻当即请三度出手。张无忌独斗三度的金刚伏魔圈，各种武功用遍也无法取胜，仅能靠太极拳苦守。
武当七侠赶到峻极峰，见张无忌与少林三度战斗虽激烈，却还没到危急之时，当下跟各大派之人见礼，讨要人情。昆仑派、崆峒派、青海派却不过武当派的厚礼，终于答应只要张无忌改邪归正，不再追究张无忌之责。少林、华山有众多弟子死于赵敏、张无忌之手，却不愿答应武当七侠的请求。
俞岱岩仗着和峨嵋派关系亲近，拐弯向史应龙求情，史应龙却只说天子犯法与庶民同罪，一切按大华律法审判便是。武当七侠无奈，只好站好位置，等张无忌与少林三度战罢便动手抢人，以免少林、华山两派高手先下手。
张无忌见武当七侠到来，担心连累到武当派，越发着急，多次使用圣火令武功，以求险胜，但圣火令武功恰好被金刚伏魔圈克制，张无忌使用圣火令武功越发凶戾，逐渐神志昏迷，只顾强攻，甚至不顾自己安危，少林三度不欲与张无忌同归于尽，只是见金刚伏魔圈收缩至威力最高范围，然后固守不动，静待张无忌力竭而亡。
张三丰与王启年沟通不成，终于动手激斗，王启年身法似电，掌劲如针，张三丰似缓实急，太极拳柔极生刚。张三丰意在救人，王启年命不久矣，两人皆力图速战速决，王启年使出七星汇聚，斗转星移，打破张三丰太极拳防御圈，一道指劲直射张三丰印堂。张三丰避无可避，只道必死无疑。
王启年却突然停手，以指凌空点住张三丰印堂，喝问当年百损道人之事。张三丰终于说出实话，只道虽然无悔，但私德有亏，终究是做了错事。王启年哈哈大笑道：“天道承负，轮转不休。张三丰，你如今虽然认错，但早年所做下的错事，终究无法抹除，自会影响后人！”言必收手，整理衣衫之后就低坐化，丽日之下身化点点光芒，消失无踪。
原来他伤势过重，从终南山离开后，多方搜寻张三丰行迹，勉强支撑到现在，为了报仇又全力出手，加速了身体败亡，终于油尽灯枯，耗尽生机。但他通悟先天功，重返先天，又更上一层楼，体会天人化生之道，这才会有白日羽升异像。
张三丰见王启年羽化，不由百感交杂，另外他深研道理，自然知道承负之说，近几十年的记忆在脑海中飞电疾闪而过。
俞岱岩遭人暗算，浑身骨骼粉碎；张翠山迎娶魔教女子，差点自杀身亡；殷梨亭未婚妻途遇恶人，差点遇难；张无忌身中玄冥神掌，又被人掳走，这几件大事最后虽然没有出现什么太坏的结果，但张翠山最后夫妻分离，殷梨亭弃婚另娶，张无忌被美色所惑，做出众多大错之事，宋青书更是因为女人被打成废人，到如今张无忌被困，凡凡种种，皆是突兀而来的横祸，张三丰心内暗凛，却已没空细想，只能对着王启年坐化之地行了个道家之礼，然后迅速赶向峻极峰。
张翠山见张无忌状态不对，忍不住加入战圈，替张无忌承担压力，但对战斗局面毫无帮助。少林三度不欲伤及张翠山性命，却被张翠山利用，以自己的身体替张无忌抵挡攻势，并劝说张无忌停手等待张三丰到来处理。
张无忌已经入魔，毫不理会自己父亲所言，甚至主动利用张翠山生身体做遮挡来攻击对手。少林三度不为所动，仍然文弱泰山。空智讽刺宋元桥，说武当派尽出利己之人，先有殷梨亭目不识凰退婚，又有宋青书为女大肆杀害百姓，现在还有张无忌不顾父亲性命来攻击对手。
宋元桥等人羞怒不已，却又无法可说，眼见张无忌与张翠山在三度围攻之下越发不妙，危急之间张三丰终于赶到，人未到声先至，喝请双方停手。少林三度收手后退，张翠山喜极停手，一边说话一边向张无忌走去。但张无忌已经丧失理智，误把张翠山当作对手，一掌打中张翠山胸口，将张翠山击飞，又攻向少林三度，双方继续战在一起。
张翠山被击飞，凌空喷血，张三丰飞身接住，却发现爱徒心脉已碎。张翠山满嘴鲜血，只留下三个字：“救无忌……”便死去。张三丰悲愤莫明，长啸中身如闪电切入战局，火力全开，一手揽雀尾引开三度的长索，另外一手斜单鞭刷在张无忌肩膀，一下将张无忌整个人打得腿部深陷入地。少林三度凛然收手，其他围观之人对张三丰的武功惊骇不已。
张三丰忍住心中悲痛，制住张无忌并废掉他武功，向众人求情。众人转而对付赵敏。赵敏惊急不已，但双腿经脉未通无力动弹，只能强行嘴炮对付各大派之人。史应龙放开殷素素，殷素素奔去看了一眼张翠山，又奔到张无忌身边照看，众人也认出殷素素身份，各派中又有人要追究殷素素当年滥杀无辜之事。殷素素为求儿子一线生机，不敢反驳众人。
赵敏眼见自己无路可逃，说临死前要看一看张无忌，请求人帮忙把她挪到张无忌身边。班淑闲令卫四娘将赵敏提到张无忌身边。赵敏双手轻抚张无忌胸口，叹两人生不逢时。殷素素发现儿子脸色不对，一掌打翻赵敏，才发现张无忌胸口被扎了一根闪着湛蓝毒光的钢针，惊怒不已，大骂赵敏。赵敏哈哈笑道自己就要死了，她得不到的东西，宁可毁了也不愿被别人得到。殷素素恨极动手，一掌拍碎赵敏天灵盖。
张三丰与武当六侠惊急异常，上前查看张无忌情况，张三丰拔出毒针，将之打入旁边一树干上，树也立即枯落，众人见之惊惧不已。纷乱中一名僧人靠近殷素素，用大金刚掌力击中殷素素后背，殷素素喷血倒地，张三丰一边护住张无忌心脉，另一手以衣袖拂过僧人肩头制住对方后查看殷素素，发现其心脉已断，无力回天。张三丰向少林寺查问那僧人。空智连道冤冤相报何时了，向众人介绍那僧人身份。
原来那僧人是龙门镖局总镖头都大锦弟弟都小全，当年少林寺上武当山追讨龙门镖局命案，查知凶手是殷素素之后却找不到殷素素，报仇无门之下都小全拜入空智门下，苦练少林绝技，今日终于找到机会报仇。都小全为避免少林寺日后被武当派暗中寻仇，也不愿被武当派的人制住，当场逆运内力以自毁武功的代价冲开穴道，拜别空智，自逐于少林。
史应龙上前查看殷素素情况，忍不住低声追问孩子的事情。殷素素只求史应龙救人，史应龙无奈答应，殷素素留下“找冷谦”三个字后死去。
各派人马见赵敏已死，张无忌丹田已毁，武功尽失并且身中剧毒，已经再无活路，当下纷纷离去，最后只留下武当派。史应龙上前以自身血液为引替张无忌拔除毒素，张三丰道谢后抱着张无忌离开，武当六侠抱着张翠山跟上。
史应龙带着兵马返回洛阳，阿离报告日月教内乱之事，史应龙当下召回庄铮，令其带几位五行旗高手北上联系冷谦，看有没有机会说降五散人，又让庄铮暗下联系白龟寿，见机行事，另外又派贴身侍卫朱亮祖一同前去，准备私下向冷谦询问殷素素孩子的事情。
大华建国大典按时举行，史应龙称帝后对一干下属各赐封。大华整顿大军之后，正准备攻打虎牢关，不料传来紧急军情。陈友谅打败张士诚和朱元璋联手，攻占了太平州，又派水军偷袭汉阳，大燕高手尽出，史火龙不敌对手身负重伤，赵普胜无力回天，无奈率领残军撤出汉阳，于城外二十里扎营驻守。
汉阳这九省通衢被占，大燕水军可直达岳阳、荆州两大要地，情势紧急，大华内外阁通夜议事，定下向南后北攻略，决定要以雷霆之势扫荡江南，以免其他势力收拢民心，日后一统天下时部分地区民心分离。
史应龙点起十万大军，令赵德胜为帅，领军南下支援赵普胜，纪晓芙坐镇洛阳，自己带着王难故、程映秀、阿离、周芷若快马赶往汉阳，乘夜入营。众人看望史火龙，王难姑为史火龙诊治。
史火龙与赵普胜叙说汉阳败仗详细。原来是成昆执屠龙刀入水悄悄斩断拦江铁索，大燕水军乘夜直袭汉阳城外水寨，而布防两岸的大华巡逻战士被潜伏在侧的慕容家家将暗杀，竟然无人报警。水寨被破后，大燕顺势攻打汉阳城，成昆率领慕容家高手破城门而入，史火龙率丐帮众高手上前阻拦，苦战多时终不能抵，左手手掌被削掉两根手指，又被打中一指一掌，幸亏守城的两大丐帮长老拼死相救，才能保住性命撤退。而后赵普胜发现大燕军势不可抵挡，为了避免更大损失，不得已收拢残兵退出汉阳。
众人叙说未完，帐外传来敌袭警报，原来成昆要趁大华援军未至之时歼灭赵普胜部，擒拿史火龙当人质。史应龙令赵普胜去布置防务，其他人暗中埋伏好，自己扮成史火龙诱敌，趁成昆杀到身前时骤然发难，一招夺下屠龙刀并重伤成昆。成昆见机不妙立即逃跑，众多慕容家将拼死阻挡追兵。最终成昆逃脱，史应龙活抓慕容家两大家将风兴、包盛，赵普胜反包围来袭敌军，一战歼灭敌军近五千。
次日汉阳城中暗探传出情报，成昆离开了汉阳，主持防务的是大燕水军大都督程映峰，陈友谅妻舅邓再、慕容家家将公冶监军。程映秀听到程映峰名字后激动不已，和史应龙前往汉阳城下观察，发现大燕水军帅旗上有桃花岛分支程园的暗纹。
程映秀大喜过望，当夜在城外吹奏碧海潮生曲，果然引来城内萧声也以碧海潮生曲回应，等不多时，便有一黑衣人悄悄赶来相会，却正是当年与程映秀失散的程园弟子程映峰。程映秀与程映峰相认，各自叙述往事。
原来当年太湖陆家提前探知元廷要对归云庄下手，当即舍掉基业，举族出海避祸。但是天有不测之风云，陆家的船队还未到达桃花岛便遇到了大风，船队被吹离航线，远离东海，途中又再遇飓风，更是船破人亡，接连打击之下，陆家数百族人只剩下十几人，主家只有一位长老和一位女公子活了下来。众人在一座不知名荒岛住了下来，数年后那位长老因伤去世，程映峰得了那位女公子的青睐结为夫妻，却成了陆家的掌权人。
陆家在海外荒岛蛰伏多年，一直有派人勘察航线以图他日返回中原，数年前陆家终于完成了航线勘察，第一次派人返回中原打探消息，不料却被慕容家发现，成昆当即随船前去拜访陆家，一番威逼利诱之后，陆家不得不贡献出以造船、水战之术，助慕容家争夺天下。
程映秀用自己在大华的身份说服程映峰，三人定下计策，分头行事。程映峰返回汉阳之后暗中召集陆家之人，如廖永安、廖永忠、俞通海等，又说动对陈友谅早有不满的于光、欧普祥、丁普朗，暗中准备起事。
不久后赵德胜率领援军达到，史应龙率军再次兵临汉阳，程映峰立即起事，联合一干同道擒拿下监军邓再、公冶创，大华兵不刃血便夺回汉阳。史应龙乘胜追击，留下部分人手驻防汉阳后，自率领水军顺流而下，一路打穿武昌，势如破竹，直至大冶县才稍加整顿，汇合赵德胜、赵普胜后，又顺流攻打蕲州。
陈友谅听到消息后大惊失色，连忙组织残余水军与陆军奋力反抗，却无力抵抗，步步败退。陈友谅不得已放弃太平州，将兵力抽回，集中防守九江。而此时大华胡深部和方国珍联手后终于击败陈友定，平定福建后迅速回军北上，与史应龙主力前后呼应，围攻大燕。
数月之后，大华三十万大军围困江州，城内成昆、谢逊、陈友谅三代人在议事大厅枯坐无言。陈友谅感叹大业功败垂成，谢逊直言后悔当年太过冲动，辜负师傅一番苦心造诣的安排。成昆直言时也命也，慕容家数百年筹谋，如今已经是最成功的一次，纵然有错也不是谢逊哦错，只可惜当年行事不密。
原来慕容家从来没有放弃复国大业，传到成昆也就是慕容成昆这一代时，成昆好不容易把妹子当成师妹嫁给阳顶天，一直通过自家妹子的教主夫人身份获取明教各地反元势力的情报，并在其中打入钉子，暗中攫取明教的反元成果。没想到的是成昆妹子真心爱上了阳顶天，自觉如此行为太过对不起丈夫，终于与成昆起了争执。
阳顶天对成昆兄妹暗中联系的行为有所察觉，却以为是自家夫人情海生波，又恰逢他刚刚将乾坤大挪移练到第四层，阴差阳错之下竟然走火入魔就此死去。而成昆当时惧于阳顶天的武功仓皇逃走，为了不连累谢逊这个悉心培养的侄女婿加徒弟，仓促之间与谢逊之父布下欺凌徒媳的惨案，就此转换身份另行复国之策。
而成昆妹子迅速为阳顶天殉情，也没有将阳顶天已死的消息传出，害得谢逊数十年里滥杀无辜，为明教招惹了很大麻烦。谢逊的疯狂行为因为更加方便成昆暗中接收明教在各地的反元势力，故此成昆也不告诉徒弟真相，反而专心培养谢逊之子谢无忌，也就是慕容家下一代家主慕容无忌如今的大燕国主陈友谅，直到天下局势逐渐明朗，才将谢逊召回，说清一切缘由。
到如今大燕将灭，为了慕容家将来打算，谢逊和成昆决定各自带一个陈友谅的儿子突围。谢逊和成昆突围，谢逊被被史应龙和史火龙截下，成昆带着陈友谅小儿子儿子逃离江州，不料遇上听闻屠龙刀消息的灭绝，被灭绝所杀。江州城破之后，陈友谅自焚而亡，慕容家从此再无传人。
大燕灭亡之后，大华兵锋北上，恰逢各路反元义军势力头领除朱元璋之外纷纷中毒而亡，内乱纷纷，大华轻而易举便扫平江南，朱元璋见再无机会，顺势降了大华。日月教内讧后，五散人心灰意冷，将手中剩余的兵力交给庄铮之后，急流勇退，从此游戏江湖。而殷素素托付给冷谦的小儿子，却在殷天正毒发身亡后被殷无福、殷无寿带朝往鲜躲藏。后来史应龙以寻找儿子的接口为由，不断向李朝氏鲜施压，李氏不堪压力，举国投降，史应龙最后虽朝将鲜收回，却始终找不到殷无寿、殷无福。
大华一统江南后，历经一年整顿，分三路北上伐元，一路势如破竹，不过两年，便将蒙古人赶出中原，将国境北推至北海（贝加尔湖）中原恢复华夏正统。
为了控制武林中人，史应龙建立了华夏武林大联盟，简称武联，规定凡是各大门派学武之人必须向武联报备，单凡有个各派弟子违反律法的，如其师傅不清理门户将之执拿至官府，师傅受连坐之罪。因大华势盛，各大门派也是获利势力之一，当下天下武林人士纷纷加入武联，享受可参选武官待遇。
为了提高武联的名誉，史应龙派人上武当山请张三丰担当武联名誉盟主，却遭到张三丰回书拒绝。史应龙拿着最后署名为“大元遗老张三丰”的书信冷笑不已，评论道：“张三丰又名张全一，其人生于宋时，长于宋时，但前宋灭亡之时，不见其自称大宋遗老，如今蒙元灭亡，却自称大元遗老，真是心志可嘉啊。”
随后，史应龙将张三丰的回信及自己的评语刻碑立字，竖于展旗峰下，至此天下人大多不喜武当派，武当派逐渐没落。史应龙又在伏魔峰上上大兴土木，重建石佛寺，请了鹿门寺的果慧大师来主持，渐渐武当山佛教大盛，竟成为天下六大佛教圣地之一。
灭绝在江州拿走屠龙刀，回峨眉取出刀剑中秘籍后，将断刀断剑重铸成四柄神剑，留为镇派神兵，其后又离山游行，除多年后传回一套脱胎于慧心剑诀的灭绝剑绝外，再无踪迹。纪晓芙将掌门之位传于周芷若，数年后周芷若、阿离给史应龙，数位峨嵋派弟子嫁入皇家，引起天下权贵以迎娶峨嵋派女弟子为荣的风潮，各家女子均以拜入峨嵋派为荣。傅十妹于周芷若之后接任掌门之位，将峨嵋派分为僧俗两支，立下峨嵋派不收男子的门规，与王家姐妹将峨嵋发扬光大，终成天下第一大派。
在史火龙的支持下，武青樱终究嫁给了史应龙，产子时难产而死，其儿史安善被不育的王难姑和蓝澜收养，最后被封滇王，永镇西南。朱九真最后招来蓝玉为婿，夫妇俩将朱家发展成大华豪门之一。
因天下太平，百业俱兴，丐帮渐渐没落，经史火龙努力之后，丐帮改组成为净衣派，专门替皇家巡查天下，密报官员权贵不法之事，与明玉珍控制的莲花社同被暗骂为皇鹰犬。程映峰重建程园，与白龟寿控制的白驼山庄共同组建成皇家商团，将大华物产通过水路两路销往域外。五行旗最后转为大华制造局，专门研制器械火药，因为地位清贵，工酬高而吸引了不少大华子民，倒也发展的颇为兴盛。
大华立国二十五年后，传位给纪晓芙所生的儿子史立善，又将其他儿子交给史火龙安排承嗣之任，自己带着诸多红颜知己跑到神农架百毒谷归隐，又将杨映雪从古墓接到百毒谷共住。
五年后，段子羽和治好丹田重新练回武功的张无忌前往百毒谷，一路上两人连续被傅十妹、杨庆善、史安善三人击败，奇怪这三人却只是打赢了就走。段子羽、张无忌两人进入百毒谷后，直面史应龙，两人联手以九阳神功和六脉神剑围攻史应龙，却不撑不过十招便被擒下。
史应龙擒下两人后，传音谷外，请张三丰现身一战。张三丰现身入谷，史应龙叙说自己以龙象般若功为基础，以临济十二桩、先天功为参照，糅合了九巴掌（降龙二十八掌）的运劲方式，创下一门叫十三太保横练的武功，如今进无可进，特地向张三丰请教。
史应龙与张三丰交手，两方各施展绝技，招出即引动天地色变。两一招分高下，史应龙哈哈大笑道：“吾道成矣。张真人，你太老了，却已无如此机会。”张三丰叹道：“不错，恨不能早六十年有此机遇。”
张三丰就此离开百毒谷，也不理会张无忌，从此绝迹人间。史应龙将段子羽和张无忌交给史立善处理，大华以打击段式反动恐怖余孽的接口向西南发展，一举灭掉东吁国，将国境扩展至孟加拉湾，与天竺接壤，从此大华成为横跨亚洲的超级大国。
史应龙废功重练十三太保横练，废立十二重后，终于功成圆满，破碎虚空，在虚空路上遇到一道人名曰且留步，顿时记起当年就是此道人惊走黑白无常，救回自己一命。史应龙向道人感谢救命之恩，且留步却苦笑说是无意之失，当年自己替师门北海分水将军府到四川地界办事，需要向黑白无常咨询信息，却没想到落下了一个幼小游魂，送返肉身途中不慎沾染了些许后世气息，最终造成天下大变，另得北海分水将军一脉与真武大帝一脉交恶，实在是意外。
史应龙仍然谢过且留步，又询问可有帮助纪晓芙等红颜知己的办法，且留步透露上界月老有三生回溯仙法，可追溯男女三生中的情缘，以此为能拉人跳出下界。史应龙记下消息后，毅然上路，独生闯荡上界，这又是另一段传奇。
（全书终）