通过重金贿赂使得清廷使者免去朝鲜国王郊迎仪式后，为了不在礼仪问题再节外生枝，清朝双方很快就开始了对三道沟事件人犯的审讯。在勘罪进程中，为了避免引火烧身，朝王李焞极力主张要“宽大”处理犯罪官民，主动提议将施放鸟枪打伤清军的六名主犯处斩、妻子为奴、其余越境者十九名因同参越境亦处死、涉嫌玩忽职守和纵容越境的朝鲜官员处以革职流二千里及降等二级或五级的惩罚。
勘罪进程完结后，清使申请国王拟定一份谢罪书。此时，朝鲜三公到清使驻地楹外自请受罚，声称让国王以文字书写好像供答于“事体”不安。面对朝鲜方面的态度坚决，拿人手短的清使最后不得以之下只好让国王口头向清廷谢罪。
李焞为此谢罪道：“边民犯法潜越放鸟枪损伤官人••••••非敢有一毫漫忽之心，而事至于此，莫非禁令不严之致，今奉皇敕惶悚罔措••••••”
看起来三道沟事件到此有了一个不错的结尾，然而朝鲜重臣还来不及感到万幸，事情就起来变化。朝鲜派出以右议政郑载嵩为首的三使臣组成陈奏使抵达北京时，从正准备返回朝鲜的冬至（朝贺）使那里打听到国王被罚银二万两的音讯，三使臣愤愤然，当即决议呈文礼部为国王辩解。他们旁征博引，罗列历代朝鲜人得罪清朝时处罚止于自己而未及国王的事例，指出罚银国王“有乖于大朝前后体贴之盛典”。
接到朝鲜三使臣的呈文后，清朝廷内有人主张立即捉拿三使臣，也有人主张将其押解回朝鲜处置。但由于东南方面明郑的威胁日趋严重，再加上清廷已经隐约听到朝鲜与东宁之间有所联络，因此康熙的态度显得较为宽容。
当清廷礼部提议下发敕书斥责时，康熙指出“此非小事，不必特降谕旨，但照所撰敕语，令该部缮本具奏，俟启奏时，止票依议耳。”康熙考虑到事发之初已经下敕书令察议朝鲜国王，假如再发敕书问罪三使臣，不免使“朝人心思离散、徒徒增益海逆，与国朝有损”。
于是，康熙命令礼部在奏闻时写上问罪三使臣的内容，他自己只表“依议”，这样即可以向朝鲜施压又显示了自己的宽大不至事态发展到清、朝之间出现严重对立的一幕。
永历四十年、康熙二十五年闰四月，清廷礼部再度向朝鲜方面发出敕书。
敕书中首先罗列了最近朝鲜的种种“罪行”，如清使到汉城时国王没有恪守郊迎之礼；朝鲜使臣在北京违禁置办野史、并提出辨诬申请；以日本海盗入侵为借口申请军援，结果军援到了之后却没有任何音讯；三藩之乱时用浮词探真假等等。
其次敕书中又罗列清朝历代对朝鲜国王罚银的处置以及礼部提议后被皇帝免议的事例，呵斥“以从前之姑宽者为例，反谓无可罚之情，何其谬欤？”并呵斥“卑职不告其君，而轻弄笔端横开祸始，皆由其国主弱臣强”。
敕书的最后部分由清廷礼部提议将郑载嵩等朝鲜三使臣抓捕并押解朝鲜重处。
对此，康熙谕令：“免其严拿，其他依议”。
“这，这简直是奇耻大辱。”朝王李焞看着手中的清廷礼部咨文勃然大怒道。“主弱臣强？朕是无道昏君坐视权柄沦落奸宦之手，还是尔等是谋朝篡位的逆党？简直是大污蔑，是丙子虏乱（注：丁卯胡乱和丙子虏乱均指满人入侵朝鲜）以来从未有过的污辱。”
李焞坐下的朝鲜群臣的脸上也是一片铁青，是的，不会有人愿意被人指摘为乱国权奸的，因此清礼部的指责实际上让四分五裂的朝鲜政坛出现了同仇敌忾的气氛。
“臣以为应该立刻与东宁恢复贸易，以朝鲜的马匹、条铜、生铁、棉花、奴婢换取东宁的火炮、火药、硫磺、铠甲以备不时之需。”司谏院正言韩泰东摆出一副强硬的态度来。“本朝使臣也可以南下东宁参拜大明监国，求取（两国联手）的诏书。”
“过于激烈了吧。”李瑞雨皱着眉头。“整备军务动静不小，万一被清廷探知，那来的就不是一道敕书了。”丙子虏乱已经过去快半个多世纪了，但一来清军的强大让朝方记忆犹新，这二来嘛，朝鲜的军队实在是烂泥扶不上墙，故此由不得李瑞雨不担心以强硬对强硬会适得其反。“各位大人还要慎重其事啊。”
“采买大炮、火药什么或可以慢慢去做，但拜谒大明监国一事倒也未必不可行。”领议政宋时烈摸了摸胡子。“不过老夫却以为如今的东宁不循义理，不重文章，已经失去中国的道德，几沦为商贾之流，要与其打交道，怕是要费些周章的。”
“大陆沦陷，大批正人君子到被清廷屠戮，郑氏又是海盗出身根底浅薄，因此东宁沦为商贾倒也正常。”大司宪金万重双眼微眯。“不过商贾也有商贾的好处，明码实价嘛。”说到这，他向朝王李焞建议道。“臣请以公主、宗女和亲东宁，约为兄弟。”
李焞还没回答，边上的一名右议政就吼了起来：“金大人，此事过于荒谬了，区区东宁能挡得住清军大举进攻吗？一旦东宁力屈为清廷剿灭，我王嫁女之事暴露，那就不是一纸诏书的事了，你这是为陛下惹祸。”
“此事荒谬吗？”金万重反问道。“难道清廷的礼部咨文不更荒谬吗？至于为朝鲜、为陛下惹祸一说。”金万重叹了口气。“这个罪名本官可承受不起。”金万重猛的张开眼睛，一道精芒射出。“大人难道不知道如今东宁已经反攻了琼州，清廷正焦头烂额呢。”
“不过一时逞顽而已。”右议政争辩道。“蜉蝣撼树、螳臂当车，是长久不了的。”
“本官自然知道郑家长久不了，可是郑家在东宁一日，清廷便如梗在咽一日，更无暇对朝鲜用兵一日。”金万重斩金截铁的说到。“臣以为这才是清廷不加以进一步威逼的初衷。”
“但这也未必要以公主相嫁，而且这样做的动静更大。”晋升为左议政的南九万急切的和着稀泥。“而且东宁方面也未必愿意了，还是先派人探一下对方的口风为好。”这么一说，金万重也无话可说了，毕竟刚刚的建议是他剃头挑子一头热。“东宁郑家要联络，但缓不应急，如今重要的是先把清廷敷衍过去。”南九万这话说到了重点，一时间殿内人纷纷点头。“臣以为应该先向清廷派出谢恩使，以示恭谨。”
这话真有意思，清廷对朝鲜算得上极度污辱了，可是朝鲜还得为清廷没有当场捕拿朝鲜三使臣而再度派人到北京谢恩，由此可知国家弱小的结果只有唾面自干，但若是国力强大还要事事退让，这就属于自虐了，当然还有一种可能就是外圣内王。
李焞叹了口气，点点头：“就由南卿出使北京吧。清人要是还不愿就此善罢甘休，卿可以向清廷提议将三使臣革职、定配，真是委屈他们几个了。”
“臣领命！”借助胆怯的李焞和清人之手扫除政敌的南九万脸上故意露出意思兔死狐悲的表情，但很快脸上一肃，进一步阐述道。“只是单单派出谢恩使怕还不够，只怕废四郡的形势不做改变，日后两国也会再起纠纷••••••”
中朝两国以鸭绿江、图们江为界的局面是在明朝初年形成的。它是朝鲜半岛的高丽王朝和朝鲜王朝不断向北拓展领土的结果。元末明初旧元势力退出朝鲜半岛形成势力真空，高丽王朝趁机向北拓展领土，在鸭绿江下游南岸一带，沿昌城、碧洞、江界一线，设置了一系列邑镇。向北收复双城总管府一直推进到吉州，并在吉州以北、图们江以南地区与女真人展开攻防战。公元1392年李成桂发动易姓革命，建立新兴的朝鲜王朝，继续向鸭绿江上游及图们江下游一带推进。特别是朝鲜第四代国王世宗（1419-1450年）积极推行北进政策，沿图们江下游南岸一带设置六镇，鸭绿江上游南岸一带设置四郡，从而以鸭绿江、图们江天险做为其北拓领土的前哨基地。但是，上述地区本属于女真领地，由于女真人不断反抗和偷袭，世宗去世后不久，朝鲜不得不放弃鸭绿江上游的四郡，女真人重回旧地，形成朝鲜历史上所谓“废四郡”地区。16世纪末17世纪初，努尔哈赤在统一女真各部、建立后金的过程中，征调鸭绿江上游、长白山南麓及图们江中下游女真壮丁，统统卷归兴京编入八旗。从此，女真人再也没有回到上述地区，这对朝鲜巩固鸭绿江、图们江边界是十分有利的。但此后朝鲜却利用江北广阔的无人区，屡屡越境盗采人参、盗伐林木、盗猎皮毛，清、朝两国为此屡生龌蹉，三道沟事件正是其中影响较大的一起。
南九万的声音继续在殿内回荡着：“臣请立刻颁布《南北参商沿边犯越禁断事目》，也好对清廷做个交代•••••••”
所谓《南北参商沿边犯越禁断事目》是朝鲜在三道沟事发之后便拟定的一项避免边民越境的条例，内中包括制止南北参商贸易、制止东南边采参、制止沿边地区犯越等多方面的内容。这个《事目》因为涉及到各方面的利益所以迟迟未能颁布，如今清廷逼迫日紧，不抛出些干货来怕是过不了关的。
李焞脸上的肥肉颤抖着，显然他很是不甘心，但形势比人强，他只好忍痛答应道：“准奏！”
但南九万的笑容未敛，李焞进而命令道：“宋卿，你且与大司宪议一议，该如何结好东宁••••••”