教义
藏传佛教教义特征为：大小乘兼学，显密双修，见行并重，并吸收了苯教的某些特点。传承各异、仪轨复杂、像设繁多，是藏传佛教有别于汉地佛教的一个显著特点。显宗说一切有部、经部、唯识、中观四宗中以中观为最发达。龙树一系的论典以“正理聚六论”为中心，经过宗喀巴的倡导，中观应成派月称所著的《入中论》最受推崇，成为中观论著的代表作。《现观庄严论》与《入中论》两书汉文未译，而龙树的《大智度论》藏文未译，因而成为藏传与汉传佛学之一重要区别。西藏密教一般分为事部、行部、瑜伽部、无上瑜伽部等四部，而各宗派多以无上瑜伽部的各种教授为主要修行法门。
传承方式
藏传佛教的传承方式既有师徒传承方式，如宁玛派、噶举派、噶当派；也有家族传承方式，如萨迦派，基本上采用以昆氏家族为基础的家族传承方式。但最具特色的还是活佛转世制度。“政教合一”是喇嘛教的另一大特点。历史上，藏传佛教的多数派别都和一定的政治势力（包括地方实力集团或家族势力）结合在一起，形成政教合一制度，教依政而行，政持教而立，彼此依存。这一制度在吐蕃赤祖德赞赞普时初见雏形，至萨迦派时正式确立，其后不断完善，待格鲁派掌西藏地方政教大权后而达鼎盛。1959年西藏民主改革时废除。
学制
藏传佛教传习和修证的处所分为讲道院和修道院两种，也有综合者。较大的寺院都有规定学制。各派各寺的规定不完全相同。如格鲁派哲蚌寺郭莽札仓规定：因明五年，般若四年，中观两年，俱舍四年，戒律一年，必须循序而进。戒律学完之后统称噶仁巴（经学士），其出路有三：1、少数申请应试格西学位，2、自由讲学或闭关修持，3、入密宗学院继续深造。藏传佛教的学位有多种名目，如噶希（四论士）、饶绛巴（博学士）等，原仅为尊称，后学制逐渐严密，须经过考试才能取得诸如拉仁巴、多仁巴、林赛、曼仁巴（医药士）等各种称号，统称为格西。
寺院
藏传佛教的寺院规模大小不一，小者只有数人，大者多至七八千人。大寺院一般由经堂、神殿、做为辩经场所的林苑、印经院，若干活佛拉章、僧舍、执事者的办事处、仓库、招待施主的客房、牲圈等等组成。寺院在旧西藏往往是一个地区的宗教、文化乃至经济、政治中心。中华人民共和国成立后，重要的寺院依其重要的程度分别规定为国家级、省级、县级的文物重点保护单位。文/革期间许多寺院受到严重的破坏，1979年以后由政府资助和信徒群众自愿集资逐渐恢复。
藏文《大藏经》
藏传佛教的文献极为丰富。藏文《大藏经》分《甘珠尔》和《丹珠尔》两大部分，其中《甘珠尔》包括显密经律，主要为佛教的原始经典，《丹珠尔》为论藏，系释迦牟尼弟子对佛语的阐释和论述的译文集成。
六字真言、六字真经或六字大明咒，是藏传佛教诵咒“嗡、嘛、呢、叭、咪、吽”六个字。据说是佛教秘密莲花部之根本真言。对“六字真言”的诠释颇多，但究其根本，不外乎以下几种：
（1）据藏传佛教经典记载，六字真言，“嗡”表示“佛部心”，谓念此字时，自己的身体要应于佛身，口要应于佛口，意要应于佛意，认为身、口、意与佛成一体，才能获得成就；“嘛呢”，梵文意为“如意宝”，表示“宝部心”据说此宝出自龙王脑中，若得此宝珠，人海能无宝不聚，上山能无珍不得，故又名“聚宝”；“叭咪”梵文意为“莲花”，表示“莲花部心”，以此比喻法性如莲花一样纯洁无瑕；“吽”，表示“金刚部心”，祈愿成就的意思，意谓必须依赖佛的力量，才能得到“正觉”，成就一切，普度众生，最后达到成佛的愿望。藏传佛教把这六个字看作是经典的根源，主张信徒循环往复持诵思维，念念不忘，认为这样才能积功德，功德圆满可以解脱；布达拉宫
（2）松赞干布《嘛呢教言集》阐述了“六字真言”的多种修持方法和深刻含义。说“六字真言”中的六字代表度脱六道众生，破除六种烦恼，修六般若行，获得六种佛身，生出六种智慧等；
（3）藏传佛教萨迦派大师索南坚赞《六字明功德颂》记载：“嗡”能消除天界生死苦，“嘛”能消除非天斗争苦，“呢”能消除人间生老病死苦，“叭”能消除畜生役使苦，“咪”能消除饿鬼饥渴苦，“吽”能消除冷热地狱苦。诸佛密乘咒，诸法集精英，众生现祥瑞，灌顶六字明，诸佛心灌顶，今当与汝授，诸佛皆集会，灌顶明王咒。“嗡”施到彼岸，无悭世至尊，诸佛集法身，乞加持灌顶！“嘛”忍到彼岸，无怒世至尊，大乐受用身，乞加持灌顶！“呢”戒到彼岸，无垢世至尊，三身成化身，乞加持灌顶！“叭”定到彼岸，无乱世至尊，所知一切身，乞加持灌顶！“咪”勤到彼岸，无懈世至尊，智慈普利语，乞加持灌顶！“吽”慧到彼岸，集事世至尊，威力总摄意，乞加持灌顶！法语六字金刚声，诸佛如来皆加持，法藏精要至无上，乞求灌顶并加持；
（4）《藏语系佛教念诵集》云：“嗡”具五智慧，“嘛”遍一切慈，“呢”引导六众，“叭”息一切苦，“咪”梵众苦厄，“吽”聚诸功德。六字被加持，雪域众有’情，愿往解脱道！诸佛悉加持，最精密要藏，福利来源处，成就的根本，往生善趣阶，禁闭恶趣门”；
（5）西北民族学院多识教授云：六字大明咒象征“具足佛身，佛智的观世音关照”；
（6）云南社会科学院赵橹先生对“六字真言”有着自己独特的研究，给人以耳目一新的感受。他研究认为：广泛流传于藏传佛教的“六字真言”，系直接由密教而来。“六字真言”原是在印度的一句祷祝词，被婆罗门教和印度教继承下来，更为密教所吸取。作为密教的诵咒，辗转流播，其古意渐渐为人淡忘。知其然而莫解其所以然了。“六字真言”的首尾两字是虚词，中间两字是实词。梵文原意读为“嗡！嘛呢叭、咪，吽！”“嗡”、“吽”为虚词，在印度古文化中具有“神圣”和“吉祥”意思。“嘛呢”汉译“摩尼”，梵文原意为“宝珠”；“叭、咪”意为“红莲花”。由此，我们将“六宇真言”按梵文原意汉译为“神圣呵！红莲花上的宝珠，吉祥！”。他还认为藏传佛教文化中，不仅引进了印度密教的“六字真言”，同时也引进了密教的“红莲花上的宝珠”图案，其形象很生动，往往作为佛堂的壁画装饰。赵橹先生还对“红莲花上的宝珠”图案的造型，内容及象征意义作了独特的研究。足见“六字真言”涵纳藏传佛教义理之精髓。
藏传佛教徒常念六字真言，恰如内地佛教徒常念“南无阿弥陀佛”。在藏区“六字真言”成为藏传佛教使用率最高的诵咒，几乎到了无人不知，无人不念的地步。不少人在六字真言的诵颂中降生，又在六字真言的诵颂中离世。六字真言几乎伴随着广大信教僧俗的悠悠人生，在藏区你可到处见到六字真言的字迹，“六字真言”印于经幡，飘扬于高山峻岭，江河湖吽和牧帐刹顶。飘扬于高空，流淌于江河，还刻于石块摩崖，日积月累形成壮观的高原嘛呢石刻奇景，如青海省玉树藏族自治州境内一处嘛呢石刻就有上亿之多。藏传佛教寺院的周围，佛堂佛殿的四周都有无数个里而装有“六字真言”的嘛呢轮，有些藏家门道两侧排列着嘛呢经轮，小到信徒们手拿的转经筒上刻的是六字真言，大到一间房子大小的转经轮上刻的也是六字真言。还有的书写在宽长的布条上，藏于经筒中。千百年来，藏族僧俗用此简短的真言，祈求幸福，驱逐烦恼，净化心灵。藏传佛教徒对六字真言尊崇之深厚，信仰之虔诚，确实非同寻常。若说六字真言是藏传佛教经典的根基，那么六字真言也是藏传佛教的徽章。在世人关注藏传佛教文化研究的今天，六字真言不单纯是人们祈求幸福的祷词，而有它更富魅力的文化内涵——那就是它凝聚着千百万僧俗群众的心，使他们自强不息，奋勇向前。
藏传佛教的僧职，在教内已形成一整套既严格又分门别类的选拔制度，它是维系藏传佛教寺院及僧团秩序、开展各类宗教活动的重要组织保障。其称谓众多，概括来说，大体上可分为封号性僧职称谓、学位性僧职称谓、戒律性僧职称谓和寺院组织中之僧职称谓。